Facundo Manes nació en Quilmes el 11 de enero de 1969 y estudió en la UBA, donde se recibió de médico neurólogo. Posteriormente obtuvo un doctorado en Ciencias Médicas, Neurobiología y Neurociencias en la Universidad de Cambridge.
Es investigador del CONICET y, en calidad de divulgador, publicó numerosos artículos en medios especializados y no especializados. Además, en 2008 creó la Fundación INECO, y entre 2014 y 2018 fue rector de la Universidad Favaloro.
Afiliado a la Unión Cívica Radical, en 2016 se convirtió en asesor ad honorem en el gabinete de la entonces Gobernadora María Eugenia Vidal, quien lo invitó a ser candidato a diputado nacional por Cambiemos en 2017.
Aunque finalmente rechazó la oferta, en 2021 integró la lista radical Dar el Paso en el marco de la interna de Juntos en territorio bonaerense.
A pesar de quedar detrás de su adversario Diego Santilli, en las elecciones generales ocupó el tercer lugar en la lista de Juntos y fue electo Diputado Nacional.
En octubre de 2024 rompió con el bloque de la UCR junto a legisladores referenciados en Martín Lousteau para formar la bancada "Democracia para Siempre".
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