Nacido en la Capital Federal, cursó sus estudios secundarios en el Colegio Mariano Moreno, donde fue delegado de la Unión de Estudiantes Secundarios (UES), de tendencia peronista. En 1981 formó, con otros militantes, el Frente de Orientación Nacional, de tendencia forjista, que tras la guerra de Malvinas se fusionó con el Frente del Pueblo (FREPU).
En 1983 se recibió de abogado en la Facultad de Derecho de la Universidad de Buenos Aires, donde es docente desde 1985.
En 1982 se unió al Partido Nacionalista Constitucional - UNIR, fundado por Alberto Asseff, donde tuvo una participación muy activa siendo elegido presidente de la juventud en 1983. No obstante, ese mismo año se afilió al Partido Justicialista (PJ).
En 1985, durante el gobierno de Raúl Alfonsín, fue designado subdirector general de Asuntos Jurídicos del Ministerio de Economía, bajo la gestión de Juan Vital Sourrouille.
En 1989, bajo la presidencia de Carlos Menem, fue designado superintendente de Seguros de la Nación, cargo ejercido hasta 1995.
En 1996 bajo la gobernación de Eduardo Duhalde, fue designado presidente de "Gerenciar Proyectos y Administración Sociedad Anónima", una compañía dependiente del Banco Provincia de Buenos Aires que ofrecía servicios de transparencia en los negocios.
En las elecciones porteñas de 2000 fue elegido legislador de la Ciudad de Buenos Aires por la alianza Encuentro por la Ciudad -cargo que ejerció hasta el 2003-, liderada por el exministro de Economía Domingo Cavallo, quien se presentaba como candidato a jefe de Gobierno porteño.
Al asumir Néstor Kirchner la presidencia de la Nación el 25 de mayo de 2003, Fernández fue convocado como jefe de Gabinete, cargo en el que permaneció hasta el 2008, durante la primera presidencia de Cristina Fernández de Kirchner. A partir de entonces se alejaría del oficialista Frente para la Victoria.
En 2012 fundó su propio partido, el Partido del Trabajo y la Equidad (ParTE). En 2013 se suma al Frente Renovador de Sergio Massa. En 2015 colaboró en la campaña de la candidatura presidencial Massa y en 2017 fue jefe de campaña de la candidatura a senador por Buenos Aires del exministro del Interior Florencio Randazzo por el Frente Justicialista Cumplir.
En el 2018 vuelve a reencontrarse con CFK, quien en 2019 anuncia que será Alberto Fernández el candidato a presidente para competir contra Mauricio Macri en los comicios del 2019. CFK y Alberto suman a Massa y así se conforma el Frente de Todos, quien sale victorioso en primera vuelta.
Asumió como Presidente de la Nación en diciembre del 2019. Su mandato estuvo marcado por la pandemia de la COVID-19, iniciada casi en simultáneo con su asunción.
